La società è amministrata da un Consiglio di Amministrazione composto da 11 membri, così distribuiti:
- n. 2 componente designato da altri Organismi/Enti Pubblici
- n. 2 componenti in rappresentanza delle Amministrazioni Comunali
- n. 2 componenti di organizzazioni rappresentanti la pesca e altri portatori di interessi collettivi (CNEL)
- n. 2 componenti di Organizzazioni Datoriali Agricole
- n. 3 componenti in rappresentanza di Privati
Attualmente risultano in carica i seguenti soggetti:
- Genco Stefano – Soggetti Privati – Presidente
- Bastiani Francesco – Altri Organismi/Enti Pubblici – Camera di Commercio di Bari
- Massaro Antonia – Altri Organismi/Enti Pubblici – Camera di Commercio di Bari
- Longo Michele Maria – Amministrazione Comunale di Alberobello
- Nisi Domenico – Amministrazione Comunale di Noci
- Genco Giuseppe – Soggetti Portatori di interessi collettivi – Org. del mondo pesca e acquacoltura (CNEL)
- Mastandrea Pasquale – Soggetti Portatori di interessi collettivi – Org. del mondo pesca e acquacoltura (CNEL)
- Guerra Alfonso – Organizzazioni Datoriali Agricole
- Sardano Giancarlo – Organizzazioni Datoriali Agricole
- Giannoccaro Caterina – Soggetti Privati
- Mariano Angelo – Soggetti Privati